Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms