Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms