Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms