Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms