Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms