Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms