Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms