Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK17Q00537 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK17Q00537 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK17Q00537 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK17Q00537 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK17Q00537 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK17Q00537 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK17Q00537 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK17Q00537 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK17Q00537 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK17Q00537 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK17Q00537 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK17Q00537 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDK17Q00537 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDK17Q00537 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDK17Q00537 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDK17Q00537 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDK17Q00537 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK17Q00537 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms