Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms