Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAE1P78406 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAE1P78406 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAE1P78406 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAE1P78406 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAE1P78406 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAE1P78406 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAE1P78406 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAE1P78406 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAE1P78406 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAE1P78406 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAE1P78406 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAE1P78406 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAE1P78406 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAE1P78406 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAE1P78406 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAE1P78406 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAE1P78406 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAE1P78406 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAE1P78406 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAE1P78406 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAE1P78406 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAE1P78406 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAE1P78406 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAE1P78406 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAE1P78406 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAE1P78406 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAE1P78406 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAE1P78406 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAE1P78406 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAE1P78406 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAE1P78406 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAE1P78406 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAE1P78406 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAE1P78406 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAE1P78406 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAE1P78406 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAE1P78406 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAE1P78406 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAE1P78406 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAE1P78406 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAE1P78406 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAE1P78406 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAE1P78406 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAE1P78406 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAE1P78406 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAE1P78406 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAE1P78406 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAE1P78406 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAE1P78406 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAE1P78406 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAE1P78406 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAE1P78406 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAE1P78406 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAE1P78406 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAE1P78406 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAE1P78406 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAE1P78406 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAE1P78406 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAE1P78406 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAE1P78406 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAE1P78406 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms