Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB4BP68371 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms