Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms