Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms