Protein–RNA interactions for Protein: P60953

CDC42, Cell division control protein 42 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42P60953 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42P60953 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42P60953 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42P60953 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42P60953 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42P60953 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42P60953 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42P60953 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42P60953 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42P60953 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42P60953 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42P60953 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42P60953 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42P60953 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42P60953 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42P60953 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42P60953 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42P60953 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42P60953 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42P60953 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42P60953 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42P60953 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42P60953 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42P60953 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42P60953 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42P60953 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42P60953 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42P60953 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42P60953 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42P60953 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42P60953 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42P60953 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42P60953 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42P60953 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42P60953 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42P60953 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42P60953 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42P60953 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42P60953 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42P60953 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42P60953 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42P60953 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42P60953 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42P60953 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42P60953 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42P60953 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42P60953 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42P60953 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42P60953 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42P60953 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42P60953 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42P60953 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42P60953 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms