Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTBP60709 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTBP60709 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTBP60709 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTBP60709 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTBP60709 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTBP60709 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTBP60709 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTBP60709 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTBP60709 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTBP60709 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTBP60709 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTBP60709 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTBP60709 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTBP60709 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTBP60709 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTBP60709 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTBP60709 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACTBP60709 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTBP60709 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTBP60709 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTBP60709 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTBP60709 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTBP60709 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTBP60709 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTBP60709 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTBP60709 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTBP60709 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTBP60709 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTBP60709 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTBP60709 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTBP60709 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTBP60709 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTBP60709 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTBP60709 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTBP60709 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTBP60709 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTBP60709 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTBP60709 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ACTBP60709 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ACTBP60709 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ACTBP60709 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTBP60709 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTBP60709 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTBP60709 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACTBP60709 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTBP60709 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTBP60709 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTBP60709 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACTBP60709 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTBP60709 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACTBP60709 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTBP60709 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACTBP60709 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTBP60709 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTBP60709 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTBP60709 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTBP60709 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTBP60709 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTBP60709 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTBP60709 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTBP60709 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTBP60709 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTBP60709 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTBP60709 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTBP60709 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTBP60709 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTBP60709 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTBP60709 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTBP60709 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTBP60709 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTBP60709 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTBP60709 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTBP60709 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTBP60709 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTBP60709 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms