Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIK1P57059 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIK1P57059 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SIK1P57059 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIK1P57059 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIK1P57059 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SIK1P57059 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIK1P57059 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIK1P57059 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIK1P57059 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIK1P57059 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIK1P57059 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIK1P57059 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIK1P57059 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIK1P57059 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SIK1P57059 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIK1P57059 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIK1P57059 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIK1P57059 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIK1P57059 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIK1P57059 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIK1P57059 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIK1P57059 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIK1P57059 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIK1P57059 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SIK1P57059 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIK1P57059 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIK1P57059 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIK1P57059 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIK1P57059 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIK1P57059 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIK1P57059 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIK1P57059 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIK1P57059 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIK1P57059 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIK1P57059 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIK1P57059 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIK1P57059 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIK1P57059 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIK1P57059 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIK1P57059 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIK1P57059 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIK1P57059 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIK1P57059 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIK1P57059 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIK1P57059 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIK1P57059 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIK1P57059 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIK1P57059 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIK1P57059 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIK1P57059 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIK1P57059 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIK1P57059 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIK1P57059 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIK1P57059 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIK1P57059 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIK1P57059 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIK1P57059 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIK1P57059 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIK1P57059 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIK1P57059 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIK1P57059 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIK1P57059 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIK1P57059 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIK1P57059 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIK1P57059 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIK1P57059 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIK1P57059 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIK1P57059 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIK1P57059 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIK1P57059 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIK1P57059 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIK1P57059 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIK1P57059 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIK1P57059 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIK1P57059 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIK1P57059 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SIK1P57059 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SIK1P57059 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIK1P57059 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIK1P57059 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIK1P57059 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIK1P57059 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SIK1P57059 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIK1P57059 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIK1P57059 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIK1P57059 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIK1P57059 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIK1P57059 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIK1P57059 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIK1P57059 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIK1P57059 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SIK1P57059 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIK1P57059 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIK1P57059 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIK1P57059 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIK1P57059 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIK1P57059 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIK1P57059 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIK1P57059 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms