Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME5P56597 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME5P56597 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME5P56597 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NME5P56597 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NME5P56597 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME5P56597 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME5P56597 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME5P56597 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME5P56597 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME5P56597 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME5P56597 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME5P56597 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NME5P56597 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME5P56597 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME5P56597 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NME5P56597 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME5P56597 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NME5P56597 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME5P56597 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME5P56597 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME5P56597 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME5P56597 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME5P56597 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME5P56597 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME5P56597 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME5P56597 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME5P56597 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME5P56597 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME5P56597 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME5P56597 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME5P56597 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME5P56597 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME5P56597 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME5P56597 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME5P56597 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME5P56597 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME5P56597 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME5P56597 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME5P56597 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME5P56597 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME5P56597 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME5P56597 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME5P56597 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME5P56597 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME5P56597 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME5P56597 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME5P56597 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME5P56597 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME5P56597 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME5P56597 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME5P56597 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME5P56597 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME5P56597 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME5P56597 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NME5P56597 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NME5P56597 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME5P56597 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME5P56597 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME5P56597 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME5P56597 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME5P56597 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME5P56597 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME5P56597 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME5P56597 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME5P56597 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME5P56597 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME5P56597 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME5P56597 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME5P56597 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME5P56597 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME5P56597 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME5P56597 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME5P56597 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME5P56597 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME5P56597 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME5P56597 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME5P56597 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME5P56597 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME5P56597 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME5P56597 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME5P56597 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME5P56597 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME5P56597 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME5P56597 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME5P56597 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME5P56597 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME5P56597 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME5P56597 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME5P56597 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME5P56597 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NME5P56597 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NME5P56597 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NME5P56597 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME5P56597 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME5P56597 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME5P56597 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME5P56597 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME5P56597 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME5P56597 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms