Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AIF1P55008 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AIF1P55008 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AIF1P55008 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AIF1P55008 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AIF1P55008 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AIF1P55008 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AIF1P55008 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AIF1P55008 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AIF1P55008 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AIF1P55008 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AIF1P55008 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AIF1P55008 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AIF1P55008 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AIF1P55008 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AIF1P55008 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AIF1P55008 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AIF1P55008 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AIF1P55008 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AIF1P55008 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AIF1P55008 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AIF1P55008 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AIF1P55008 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AIF1P55008 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AIF1P55008 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AIF1P55008 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AIF1P55008 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AIF1P55008 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AIF1P55008 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AIF1P55008 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AIF1P55008 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AIF1P55008 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AIF1P55008 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AIF1P55008 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AIF1P55008 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AIF1P55008 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AIF1P55008 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AIF1P55008 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AIF1P55008 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AIF1P55008 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AIF1P55008 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
AIF1P55008 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AIF1P55008 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AIF1P55008 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AIF1P55008 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AIF1P55008 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AIF1P55008 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AIF1P55008 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AIF1P55008 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AIF1P55008 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AIF1P55008 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AIF1P55008 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AIF1P55008 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AIF1P55008 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AIF1P55008 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AIF1P55008 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AIF1P55008 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AIF1P55008 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AIF1P55008 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AIF1P55008 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AIF1P55008 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AIF1P55008 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AIF1P55008 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AIF1P55008 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AIF1P55008 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AIF1P55008 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AIF1P55008 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AIF1P55008 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AIF1P55008 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AIF1P55008 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AIF1P55008 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AIF1P55008 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AIF1P55008 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AIF1P55008 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AIF1P55008 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AIF1P55008 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AIF1P55008 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AIF1P55008 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AIF1P55008 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AIF1P55008 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AIF1P55008 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AIF1P55008 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AIF1P55008 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AIF1P55008 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AIF1P55008 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AIF1P55008 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AIF1P55008 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AIF1P55008 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AIF1P55008 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AIF1P55008 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AIF1P55008 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AIF1P55008 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AIF1P55008 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AIF1P55008 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AIF1P55008 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AIF1P55008 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AIF1P55008 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AIF1P55008 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AIF1P55008 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AIF1P55008 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms