Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms