Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1B3P54709 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms