Protein–RNA interactions for Protein: P54619

PRKAG1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAG1P54619 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKAG1P54619 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAG1P54619 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms