Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB3P54284 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms