Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTCL1P53675 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTCL1P53675 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTCL1P53675 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTCL1P53675 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTCL1P53675 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTCL1P53675 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTCL1P53675 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms