Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBP50607 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBP50607 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBP50607 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBP50607 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBP50607 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBP50607 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBP50607 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBP50607 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBP50607 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBP50607 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBP50607 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBP50607 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBP50607 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBP50607 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBP50607 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBP50607 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBP50607 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBP50607 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBP50607 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms