Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP153P49790 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP153P49790 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
NUP153P49790 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP153P49790 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP153P49790 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP153P49790 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP153P49790 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP153P49790 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP153P49790 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP153P49790 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP153P49790 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP153P49790 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP153P49790 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP153P49790 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP153P49790 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP153P49790 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP153P49790 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP153P49790 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP153P49790 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP153P49790 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP153P49790 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP153P49790 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP153P49790 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP153P49790 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP153P49790 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP153P49790 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP153P49790 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP153P49790 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP153P49790 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP153P49790 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP153P49790 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP153P49790 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP153P49790 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP153P49790 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP153P49790 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP153P49790 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP153P49790 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP153P49790 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP153P49790 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP153P49790 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP153P49790 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP153P49790 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP153P49790 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP153P49790 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP153P49790 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP153P49790 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP153P49790 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP153P49790 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP153P49790 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP153P49790 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP153P49790 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP153P49790 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP153P49790 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP153P49790 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP153P49790 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP153P49790 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP153P49790 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP153P49790 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP153P49790 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP153P49790 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP153P49790 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP153P49790 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP153P49790 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP153P49790 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP153P49790 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP153P49790 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP153P49790 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP153P49790 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP153P49790 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP153P49790 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP153P49790 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP153P49790 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP153P49790 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP153P49790 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP153P49790 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP153P49790 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP153P49790 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP153P49790 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP153P49790 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP153P49790 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP153P49790 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP153P49790 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP153P49790 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP153P49790 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP153P49790 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP153P49790 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP153P49790 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP153P49790 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP153P49790 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP153P49790 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP153P49790 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP153P49790 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP153P49790 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP153P49790 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP153P49790 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP153P49790 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP153P49790 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP153P49790 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP153P49790 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms