Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms