Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ME1P48163 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ME1P48163 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ME1P48163 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ME1P48163 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ME1P48163 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ME1P48163 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ME1P48163 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ME1P48163 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ME1P48163 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ME1P48163 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ME1P48163 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ME1P48163 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ME1P48163 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ME1P48163 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ME1P48163 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ME1P48163 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ME1P48163 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ME1P48163 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ME1P48163 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ME1P48163 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ME1P48163 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ME1P48163 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ME1P48163 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ME1P48163 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ME1P48163 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ME1P48163 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ME1P48163 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ME1P48163 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ME1P48163 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ME1P48163 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ME1P48163 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ME1P48163 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ME1P48163 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ME1P48163 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ME1P48163 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ME1P48163 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ME1P48163 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ME1P48163 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ME1P48163 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ME1P48163 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ME1P48163 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ME1P48163 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ME1P48163 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ME1P48163 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ME1P48163 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ME1P48163 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ME1P48163 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ME1P48163 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ME1P48163 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ME1P48163 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ME1P48163 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ME1P48163 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ME1P48163 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ME1P48163 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ME1P48163 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ME1P48163 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ME1P48163 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ME1P48163 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ME1P48163 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ME1P48163 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ME1P48163 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ME1P48163 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ME1P48163 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ME1P48163 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ME1P48163 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ME1P48163 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ME1P48163 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ME1P48163 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ME1P48163 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ME1P48163 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ME1P48163 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ME1P48163 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ME1P48163 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ME1P48163 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ME1P48163 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ME1P48163 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ME1P48163 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ME1P48163 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ME1P48163 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ME1P48163 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ME1P48163 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ME1P48163 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ME1P48163 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ME1P48163 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ME1P48163 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ME1P48163 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ME1P48163 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ME1P48163 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ME1P48163 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ME1P48163 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ME1P48163 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ME1P48163 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ME1P48163 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ME1P48163 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ME1P48163 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ME1P48163 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ME1P48163 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ME1P48163 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ME1P48163 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms