Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms