Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PBX2P40425 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PBX2P40425 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PBX2P40425 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PBX2P40425 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PBX2P40425 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PBX2P40425 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PBX2P40425 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PBX2P40425 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PBX2P40425 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PBX2P40425 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PBX2P40425 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PBX2P40425 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PBX2P40425 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PBX2P40425 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PBX2P40425 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PBX2P40425 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PBX2P40425 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PBX2P40425 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PBX2P40425 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PBX2P40425 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PBX2P40425 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PBX2P40425 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PBX2P40425 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PBX2P40425 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PBX2P40425 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PBX2P40425 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PBX2P40425 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PBX2P40425 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PBX2P40425 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PBX2P40425 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PBX2P40425 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PBX2P40425 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PBX2P40425 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PBX2P40425 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PBX2P40425 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PBX2P40425 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PBX2P40425 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PBX2P40425 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PBX2P40425 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PBX2P40425 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PBX2P40425 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PBX2P40425 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PBX2P40425 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PBX2P40425 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PBX2P40425 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PBX2P40425 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PBX2P40425 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PBX2P40425 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PBX2P40425 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PBX2P40425 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PBX2P40425 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PBX2P40425 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PBX2P40425 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBX2P40425 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBX2P40425 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBX2P40425 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBX2P40425 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBX2P40425 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBX2P40425 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBX2P40425 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBX2P40425 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBX2P40425 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBX2P40425 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBX2P40425 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PBX2P40425 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBX2P40425 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBX2P40425 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBX2P40425 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBX2P40425 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBX2P40425 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBX2P40425 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBX2P40425 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBX2P40425 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBX2P40425 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBX2P40425 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBX2P40425 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBX2P40425 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBX2P40425 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBX2P40425 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBX2P40425 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBX2P40425 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBX2P40425 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBX2P40425 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBX2P40425 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBX2P40425 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBX2P40425 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBX2P40425 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBX2P40425 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBX2P40425 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBX2P40425 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBX2P40425 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBX2P40425 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBX2P40425 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PBX2P40425 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PBX2P40425 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBX2P40425 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBX2P40425 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBX2P40425 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBX2P40425 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms