Protein–RNA interactions for Protein: P36551

CPOX, Oxygen-dependent coproporphyrinogen-III oxidase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPOXP36551 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CPOXP36551 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CPOXP36551 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CPOXP36551 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CPOXP36551 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CPOXP36551 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CPOXP36551 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CPOXP36551 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CPOXP36551 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CPOXP36551 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CPOXP36551 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CPOXP36551 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CPOXP36551 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CPOXP36551 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CPOXP36551 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CPOXP36551 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CPOXP36551 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CPOXP36551 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CPOXP36551 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CPOXP36551 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CPOXP36551 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CPOXP36551 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CPOXP36551 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CPOXP36551 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CPOXP36551 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CPOXP36551 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CPOXP36551 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CPOXP36551 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CPOXP36551 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CPOXP36551 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CPOXP36551 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CPOXP36551 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CPOXP36551 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CPOXP36551 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CPOXP36551 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CPOXP36551 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CPOXP36551 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CPOXP36551 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CPOXP36551 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CPOXP36551 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CPOXP36551 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CPOXP36551 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CPOXP36551 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CPOXP36551 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CPOXP36551 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CPOXP36551 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CPOXP36551 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CPOXP36551 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CPOXP36551 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CPOXP36551 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CPOXP36551 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CPOXP36551 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CPOXP36551 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CPOXP36551 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CPOXP36551 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CPOXP36551 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CPOXP36551 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CPOXP36551 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CPOXP36551 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CPOXP36551 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms