Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJC1P36383 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJC1P36383 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJC1P36383 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJC1P36383 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJC1P36383 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJC1P36383 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJC1P36383 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJC1P36383 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJC1P36383 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJC1P36383 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJC1P36383 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJC1P36383 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJC1P36383 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJC1P36383 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJC1P36383 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJC1P36383 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJC1P36383 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJC1P36383 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJC1P36383 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GJC1P36383 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GJC1P36383 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJC1P36383 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJC1P36383 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJC1P36383 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJC1P36383 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJC1P36383 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJC1P36383 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJC1P36383 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJC1P36383 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GJC1P36383 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJC1P36383 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJC1P36383 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJC1P36383 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GJC1P36383 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJC1P36383 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJC1P36383 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJC1P36383 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJC1P36383 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJC1P36383 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJC1P36383 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJC1P36383 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJC1P36383 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJC1P36383 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJC1P36383 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJC1P36383 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJC1P36383 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJC1P36383 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJC1P36383 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJC1P36383 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJC1P36383 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJC1P36383 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJC1P36383 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJC1P36383 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJC1P36383 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJC1P36383 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GJC1P36383 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJC1P36383 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJC1P36383 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJC1P36383 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJC1P36383 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJC1P36383 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJC1P36383 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJC1P36383 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJC1P36383 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJC1P36383 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJC1P36383 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJC1P36383 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJC1P36383 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJC1P36383 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJC1P36383 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJC1P36383 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJC1P36383 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJC1P36383 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJC1P36383 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJC1P36383 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJC1P36383 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJC1P36383 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJC1P36383 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJC1P36383 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJC1P36383 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GJC1P36383 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GJC1P36383 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJC1P36383 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJC1P36383 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJC1P36383 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJC1P36383 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJC1P36383 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJC1P36383 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GJC1P36383 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJC1P36383 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJC1P36383 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GJC1P36383 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJC1P36383 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJC1P36383 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJC1P36383 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJC1P36383 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJC1P36383 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJC1P36383 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJC1P36383 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms