Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms