Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA3P32297 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA3P32297 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA3P32297 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA3P32297 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA3P32297 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA3P32297 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA3P32297 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA3P32297 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA3P32297 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA3P32297 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA3P32297 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA3P32297 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA3P32297 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA3P32297 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA3P32297 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA3P32297 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA3P32297 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA3P32297 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA3P32297 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA3P32297 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA3P32297 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA3P32297 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA3P32297 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA3P32297 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA3P32297 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA3P32297 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA3P32297 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA3P32297 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA3P32297 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA3P32297 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA3P32297 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA3P32297 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms