Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms