Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms