Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms