Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LMO1P25800 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LMO1P25800 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LMO1P25800 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LMO1P25800 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LMO1P25800 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LMO1P25800 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO1P25800 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO1P25800 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO1P25800 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO1P25800 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO1P25800 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO1P25800 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO1P25800 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO1P25800 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO1P25800 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO1P25800 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO1P25800 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO1P25800 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO1P25800 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO1P25800 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO1P25800 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO1P25800 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO1P25800 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO1P25800 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO1P25800 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO1P25800 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO1P25800 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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LMO1P25800 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO1P25800 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO1P25800 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO1P25800 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO1P25800 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO1P25800 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO1P25800 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO1P25800 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO1P25800 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO1P25800 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO1P25800 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO1P25800 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO1P25800 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO1P25800 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO1P25800 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO1P25800 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO1P25800 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO1P25800 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO1P25800 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO1P25800 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO1P25800 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO1P25800 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO1P25800 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO1P25800 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO1P25800 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO1P25800 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO1P25800 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO1P25800 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO1P25800 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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