Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

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Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
APCP25054 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
APCP25054 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
APCP25054 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
APCP25054 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
APCP25054 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
APCP25054 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
APCP25054 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
APCP25054 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
APCP25054 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APCP25054 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APCP25054 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APCP25054 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APCP25054 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APCP25054 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APCP25054 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
APCP25054 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
APCP25054 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
APCP25054 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
APCP25054 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
APCP25054 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
APCP25054 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
APCP25054 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APCP25054 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
APCP25054 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
APCP25054 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
APCP25054 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APCP25054 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
APCP25054 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APCP25054 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APCP25054 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APCP25054 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APCP25054 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APCP25054 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APCP25054 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APCP25054 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APCP25054 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
APCP25054 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APCP25054 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APCP25054 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APCP25054 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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APCP25054 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APCP25054 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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APCP25054 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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APCP25054 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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APCP25054 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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APCP25054 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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APCP25054 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APCP25054 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APCP25054 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APCP25054 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APCP25054 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APCP25054 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APCP25054 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APCP25054 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APCP25054 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APCP25054 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APCP25054 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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