Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms