Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHCGRP22888 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms