Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCP1P17987 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCP1P17987 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCP1P17987 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCP1P17987 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCP1P17987 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCP1P17987 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCP1P17987 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCP1P17987 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCP1P17987 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCP1P17987 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TCP1P17987 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TCP1P17987 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCP1P17987 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCP1P17987 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCP1P17987 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCP1P17987 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCP1P17987 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCP1P17987 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCP1P17987 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TCP1P17987 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCP1P17987 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCP1P17987 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCP1P17987 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCP1P17987 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCP1P17987 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCP1P17987 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TCP1P17987 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCP1P17987 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCP1P17987 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCP1P17987 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCP1P17987 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCP1P17987 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCP1P17987 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCP1P17987 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCP1P17987 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCP1P17987 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCP1P17987 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCP1P17987 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TCP1P17987 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCP1P17987 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCP1P17987 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCP1P17987 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCP1P17987 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCP1P17987 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCP1P17987 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCP1P17987 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCP1P17987 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCP1P17987 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCP1P17987 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCP1P17987 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCP1P17987 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCP1P17987 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCP1P17987 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TCP1P17987 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCP1P17987 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TCP1P17987 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCP1P17987 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCP1P17987 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCP1P17987 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms