Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSPP15924 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSPP15924 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSPP15924 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSPP15924 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSPP15924 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSPP15924 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSPP15924 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSPP15924 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSPP15924 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSPP15924 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSPP15924 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSPP15924 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSPP15924 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSPP15924 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSPP15924 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSPP15924 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSPP15924 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSPP15924 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSPP15924 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSPP15924 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSPP15924 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSPP15924 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSPP15924 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSPP15924 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSPP15924 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSPP15924 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSPP15924 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSPP15924 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSPP15924 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSPP15924 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DSPP15924 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSPP15924 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSPP15924 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSPP15924 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSPP15924 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSPP15924 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSPP15924 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSPP15924 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSPP15924 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSPP15924 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSPP15924 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSPP15924 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DSPP15924 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSPP15924 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSPP15924 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSPP15924 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSPP15924 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSPP15924 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSPP15924 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSPP15924 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSPP15924 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSPP15924 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSPP15924 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSPP15924 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSPP15924 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSPP15924 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSPP15924 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSPP15924 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSPP15924 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DSPP15924 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSPP15924 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSPP15924 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSPP15924 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSPP15924 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSPP15924 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSPP15924 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DSPP15924 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSPP15924 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSPP15924 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSPP15924 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSPP15924 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSPP15924 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSPP15924 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSPP15924 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSPP15924 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSPP15924 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSPP15924 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSPP15924 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSPP15924 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSPP15924 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSPP15924 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DSPP15924 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSPP15924 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSPP15924 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSPP15924 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSPP15924 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSPP15924 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSPP15924 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSPP15924 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSPP15924 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSPP15924 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSPP15924 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSPP15924 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSPP15924 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSPP15924 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSPP15924 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSPP15924 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSPP15924 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSPP15924 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms