Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms