Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms