Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEFHP12036 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEFHP12036 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEFHP12036 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEFHP12036 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEFHP12036 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEFHP12036 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEFHP12036 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEFHP12036 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEFHP12036 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEFHP12036 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEFHP12036 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEFHP12036 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEFHP12036 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEFHP12036 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NEFHP12036 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEFHP12036 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NEFHP12036 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEFHP12036 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEFHP12036 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEFHP12036 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEFHP12036 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEFHP12036 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEFHP12036 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEFHP12036 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEFHP12036 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEFHP12036 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NEFHP12036 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEFHP12036 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEFHP12036 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEFHP12036 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEFHP12036 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEFHP12036 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEFHP12036 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEFHP12036 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEFHP12036 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEFHP12036 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEFHP12036 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEFHP12036 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NEFHP12036 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEFHP12036 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEFHP12036 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEFHP12036 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NEFHP12036 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEFHP12036 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEFHP12036 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEFHP12036 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEFHP12036 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEFHP12036 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEFHP12036 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEFHP12036 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEFHP12036 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEFHP12036 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEFHP12036 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEFHP12036 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEFHP12036 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEFHP12036 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEFHP12036 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEFHP12036 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEFHP12036 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEFHP12036 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms