Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ89

DUX4L6, Double homeobox protein 4-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L6P0CJ89 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L6P0CJ89 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms