Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms