Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAA1P09110 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACAA1P09110 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ACAA1P09110 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACAA1P09110 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACAA1P09110 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACAA1P09110 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ACAA1P09110 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ACAA1P09110 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ACAA1P09110 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ACAA1P09110 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ACAA1P09110 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACAA1P09110 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACAA1P09110 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms