Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB5P09067 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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