Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NGFRP08138 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms